Preskúmanie a hodnotenie národných geografických genografických projektov

Spolu s programom AncestryDNA a ocenením Editors 'Choice 23andMe, Genografický projekt National Geographic zbiera a analyzuje DNA od účastníkov s cieľom poskytnúť informácie o predkoch. Súprava DNA vo výške 199 dolárov, ktorej najnovšia verzia sa nazýva Geno 2.0 Next Generation, však nie je zameraná na sledovanie vášho predka počas niekoľkých generácií. Namiesto toho sleduje migračné vzorce asi pred 200 000 rokmi, do Afriky, ktorá je „kolískou ľudstva“. Na tomto projekte sa zúčastnilo viac ako 900 000 ľudí vo viac ako 140 krajinách vrátane Bono, Stephena Colberta a Yo-Yo Ma.

Prvá fáza genografického projektu, ktorá sa začala v roku 2005, zhromažďovala DNA a spolupracovala s vedeckými tímami z celého sveta. Geno 2.0, druhá fáza, analyzoval DNA na bližšej úrovni a zhromaždil oveľa viac genetických údajov. Najnovšia verzia - Next Generation - uvedená na trh v roku 2016 prostredníctvom partnerstva s spoločnosťou Helix, spoločnosťou zaoberajúcou sa genetickým testovaním, dodáva ešte väčšiu presnosť. Časť výnosov z predaja súprav DNA smeruje na granty National Geographic Society.

Nastavenie a rozhranie

Kým zberné súpravy AncestryDNA a 23andMe vyžadujú, aby ste vyplivli do skúmavky, proces zberu DNA Geno 2.0 je dosť odlišný. Tu použijete plastový tampón, ktorý vyzerá ako dvojrozmerná zubná kefka, aby ste si oškrabali vaše vnútorné tváre.

Súprava obsahuje dva jednotlivo zabalené tampóny; Zistil som, že každý z nich je trochu ťažké otvoriť (myslím, tvrdohlavý vrece zemiakových lupienkov). Jeden po druhom, zoškrabávate si vnútro svojich líc po dobu 45 sekúnd - použil som časovač. Škriabanie podporuje tvorbu slín, takže trochu slintáte, akoby ste u zubára. Potom vytiahnite tampónovú hlavu do injekčnej liekovky, čo bolo veľmi ľahké, a pevne ju uzavrite.

Keď ste odobrali obe líce, vložte obidve fľaštičky do priloženého plastového vrecka a vložte spolu s formulárom súhlasu do vopred určenej obálky. Doprava nie je predplatená; pri preprave z USA vás bude stáť asi päť poštových známok. Predkovia ponúkajú bezplatné poštovné, zatiaľ čo 23andMe vám účtuje ďalších 9, 95 dolárov na pokrytie dopravy v oboch smeroch. Môžete sa rozhodnúť zostať v anonymite pomocou svojho jedinečného čísla účastníka v genografickom projekte (GPID), alebo si zaregistrovať účet, aby ste mohli zaregistrovať svoje výsledky a pridať ich do databázy.

Správy o DNA a ďalšie funkcie

Geno 2.0 robí komplexnú analýzu DNA, takže moje výsledky dorazili dlhšie ako AncestryDNA a 23 a Me. Asi mesiac a pol potom, čo som poslal svoje vzorky spoločnosti Geno 2.0, som dostal upozornenie, že laboratórium izolovalo moju DNA a moje výsledky boli pripravené približne o týždeň neskôr. Do tejto chvíle som už absorboval svoje výsledky z AncestryDNA a 23 a Me, takže som mal nejakú predstavu o tom, čo očakávať. Genografický projekt však ide ešte ďalej.

Ak chcete zobraziť svoje výsledky, zadajte buď svoje číslo GPID, alebo sa prihláste do svojho účtu. V pravej hornej časti hlavného panela sa zobrazuje aktuálny počet účastníkov (k tomuto preskúmaniu 705 343). Na ľavej strane môžete vidieť, ako sú vaše výsledky určené a rozdelené. Vaše výsledky zahŕňajú tri sekcie: predkov hominínov (pred 60 000 a viac rokmi), hlboký predkov (pred 1 000 až 100 000 rokmi) a regionálny pôvod (pred 5 000 až 10 000 rokmi).

Hominínskí predkovia sa pozerajú na váš vzťah k neandertálcom a Denisovanom (objavený v roku 2008) a vypočítajú percento ich DNA, ktoré zdieľate. Hlboký predok pokrýva vaše materské a otcovské línie, známe tiež ako haploskupina, zatiaľ čo regionálny pôvod sa zameriava na DNA, ktorú zdieľate s ľuďmi na celom svete, rozdelenú do deviatich geografických regiónov. National Geographic ponúka množstvo online zdrojov, ktoré vysvetľujú vedu, ktorá stojí za ich procesom a čo znamenajú vaše výsledky DNA.

Moje výsledky určili, že mám 1, 8% neandertálskej DNA a 2, 1% Denisovanovej DNA. Podľa National Geographic je takmer každý, kto sa narodil mimo Afriky, tvorený jedným až štyrmi percentami neandertálskej a Denisovanovej DNA a priemer za obidve krajiny je 2, 1 percenta. Výsledky testu DNA 23 a Me stanovili, že som 2, 6% neandertálca, ale nekontrolovali stopy Denisovana; AncestryDNA tiež netestuje.

Testy DNA na predkov sa zameriavajú na dve sady DNA: mitochondriálnu DNA odovzdanú z matky na dieťa a chromozómovú DNA Y z rodičov na deti mužského pohlavia. Pretože od narodenia som žena, laboratórium dokázalo vyšetriť iba moju materskú líniu. Geno 2.0 ma zaradil do materskej haploskupiny T2b2, ktorá je v súlade s výsledkami 23andMe (T2b). Haploskupiny sa vytvorili, keď ľudia začali opustiť Afriku asi pred 60 000 rokmi, a sú založené na migračných modeloch. Po kliknutí zobrazíte ďalšie podrobnosti, môžete si prezrieť interaktívnu mapu, ktorá ukazuje cestu, po ktorej sa vaša materská línia vydala po celom svete a ku ktorej haploskupiny patrili vaši predkovia a kde sa vaša materská línia objavuje v Afrike.

V mojom prípade, pred 67 000 rokmi vo východnej Afrike, sa moja materská línia začala v vetve L3, ktorá je podľa Nat Geo „hlavnou vetvou matky, z ktorej vznikli všetky mitochondriálne línie DNA mimo Afriky“. Je to fascinujúce čítanie. Svoju materskú cestu môžete sledovať až po svoju súčasnú haploskupinu. (Mimochodom, moja materská haploskupina je zdieľaná 0, 1% všetkých účastníkov projektu.) Potom si môžete zobraziť tepelnú mapu svojej haploskupiny a ukázať, kde sa ľudia v tej istej skupine usadili pozdĺž migračnej trasy. Ak ste muž od narodenia, a preto máte chromozóm Y, môžete si zobraziť rovnaké informácie pre svoju otcovskú líniu.

Regionálny pôvod ukazuje vašu príslušnosť k deviatim regiónom sveta na základe celého genómu, ktorý zahŕňa obidvoch vašich rodičov, ktorí siahajú po šiestich generáciách. Moje výsledky sú 44 percent v severnej Európe, 35 percent v Stredomorí a 19 percent v juhozápadnej Ázii. Tieto výsledky nie sú také podrobné, ako to, čo ponúkajú AncestryDNA a 23andMe, ktoré ma správne pripojili k Írsku. Porovnávate sa tiež s referenčnými populáciami, ktoré sú v mojom prípade geneticky najobľúbenejšie - v Spojenom kráľovstve britské a nemecké.

Sada novej generácie dodáva viac funkcií a detailov. Siahajú až 200 000 rokov, aby ste odhalili svoj regionálny makeup a pôvod hominínov a spôsob, akým interagovali s inými druhmi. Nová generácia tiež vyhľadáva historické genetické zápasy, takže môžete objavovať pozoruhodné historické postavy, s ktorými ste príbuzní.

Získanie pomoci

Ak potrebujete pomoc alebo máte otázky pred alebo počas vašej účasti, Nat Geo ponúka dôkladnú sekciu FAQ a glosár, ale podpora nie je dostupná telefonicky alebo e-mailom. Súprava DNA obsahuje podrobné pokyny, ilustrované pokyny a kontrolný zoznam, na ktorý sa má odkazovať skôr, ako vzorku upustíte do pošty. K dispozícii je tiež brožúra s ďalšími informáciami o projekte a jeho výsledkoch. Nakoniec sa môžete prihlásiť na odber bulletinu s aktualizáciami projektu a aktuálnymi správami.

Sledujte svoje korene späť na začiatok

Genografický projekt je úplne odlišný od 23andMe a AncestryDNA v tom, že je to skôr o prispievaní k vede ako o uspokojení zvedavosti o vašom pôvode. Avšak iba Geno 2.0 vám povie, odkiaľ vaši predkovia pochádzajú, cestovali a pristávali. Je to docela cesta. Ak chcete pomôcť vedeckému výskumu a dozvedieť sa niečo viac o sebe, oplatí sa to za National Geographic Genographic Project. Podrobnejšie informácie o novších generáciách a počiatočnom bode genetického lekárskeho testovania nájdete v našom vydaní editorov 23 aMe.

DNA nemôžu testovať iba ľudia. Ak vás zaujíma dedičstvo vášho šteňa, pozrite sa aj na naše zbierky najlepších súprav DNA pre psov.